由于长期人类活动的影响,南亚热带雨林的原生植被几乎被全部破坏,保留较好的极少,只有寺庙、村庄残存的风水林和人烟较稀少的山区与陡坡等局部地段有部分残存,如永春的蓬壶仙岩洞,安溪龙涓,晋江灵源寺、金粟洞、灵秀山,南安向阳山、九都、东田等,主要类型有栲树—红栲群落、厚壳桂—红楠群落、鹅掌柴—密花树—豺皮樟群路。 此外,还有安溪龙涓乡的“米槠+栲树—九节木+百两金+连蕊茶—狗脊蕨+里白群丛”,永春溪圆海拔450米沟谷处的“鹅掌柴—冬青—芒萁群丛”,外永春海拔500米以下的低山丘陵的“米槠—苦竹+杜鹃—芒萁群丛”,晋江灵源寺、金粟洞寺的青冈栎、卡氏栲、枫香群落,晋江海拔200米以下的“相思—南岭荛花+黑面神—野古草+细毛鸭嘴草群丛”。