牛津大学自然史博物馆（英语：Oxford University Museum of Natural History），有时简称牛津大学博物馆（Oxford University Museum），是牛津大学收集陈列自然史标本的大学博物馆，位于英国牛津大学基伯尔学院对面。牛津大学自然史博物馆为达尔文发表演化论的机构；创馆时的馆长为地质学家约翰·菲利普斯，为达尔文演化论的主要怀疑者之一。该博物馆的讲座大厅，曾是1860年牛津演化论大辩论的场址，现时由大学的化学、动物学及数学系所使用。 牛津大学自然史博物馆的成立标志了牛津大学发展科学及科学园区的历史意义。