通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNPV同义密码子使用模式差异。
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1.2.1 相对同义密码子使用度分析 相对同义密码 子使用度(relative synonymous codon usage,RSCU) 是该密码子的实际观察值与理论观察值之间的比值。
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相对同义密码子使用度
Relative synonymous codon usage
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