东莞市麻涌中学创建于1956年，原来由麻涌中心小学领导和管理的小学附设初中班，于1957年划归东莞县教育局领导并正式挂牌为东莞县麻涌初级中学，1969年始办高中部，成为东莞最早的完全中学之一。 2011年，根据东莞市高中阶段学校布局调整的要求，学校实现初中部、高中部分离办学，麻涌中学从镇属完全中学成为市教育局直属普通高中，由东莞市第一中学协办。初中部招生工作转由麻涌一中负责。