主人公冲一也的父母是宇宙开发的先驱，冲一也在父母过世后继承他们的遗志成为宇宙开发的科学家，并主动要求开发小组将自己改造为用于行星开发的改造人Super-1。手术成功后不久，DOGMA军团突然袭击开发小组所在的宇宙空间站，要挟亨利博士交出Super-1，遭到拒绝后向众人发动攻击。由于控制Super1的电脑被破坏，冲一也无法变身，空间站被毁灭，Super-1坠入地球，但冲一也却奇迹生还。后来冲一也拜拳法宗师玄海为师，渐渐学会控制改造人的力量和如何变身，并以假面骑士Super-1的身份对抗DOGMA军团和KING DOGMA军团。