首都医科大学附属北京世纪坛医院办院历史悠久，其前身为铁道部北京铁路总医院。2004年6月11日，正式移交北京市卫生局管理。2005年1月1日，正式改称北京世纪坛医院。2011年7月28日，正式移交北京市医管局管理。2011年3月25日，正式成立首都医科大学附属北京世纪坛医院、首都医科大学肿瘤医学院。首都医科大学附属北京世纪坛医院致力打造“技术、服务、管理”三大优质品牌，努力建设“大专科、强综合、现代化、特色型、学院型”品牌医院，成功推进“医、教、研、防”协调发展。