北京协和医学院研究生院（中国协和医科大学研究生院）成立于1986年7月。北京协和医学院、中国医学科学院实行院校合一的管理体制，相互依托，优势互补，教研相长，向全国，承担着科研、教学、医疗三大任务。学校是首批具有博士学位和硕士学位授予权的单位，现有一级学科博士授权专业点5个、二级学科博士授权专业点47个，二级学科硕士学位授权专业点58个，一级学科国家重点学科2个，二级学科国家重点学科8个，三级学科国家重点学科2个，国家重点（培育）学科1个。每年授予博士学位人数位居全国医学院校首位。