南京大学医学院历史悠久，同时又是南京大学的新兴学院之一。前身是原国立中央大学医学院，1949年改名南京大学医学院并于三年后分出。1987年南京大学医学院复建，是全国综合性大学第一所医学院。不同于大陆大多数大学医学院，现南大医学院不是合并一所医科大学而成，因此规模相对较小，另外，不提供本科学士学位教育项目。