拟南芥基因组序列于2000年由国际拟南芥基因组合作联盟联合完成,研究结果“Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana”发表在国际期刊《Nature》上,是第一种完成全基因组测序和分析的植物。2017年,拟南芥基因组注释得到了更新,研究结果“Araport11: a complete reannotation of the Arabidopsis thaliana reference genome”发表在国际期刊《 The Plant Journal》上。