柱寿命是指色谱法在良好分离状态下的使用期限。通常色谱柱的臭名取决于固定相的性质和色谱操作条件。固定液的流失，吸附剂活性的改变，毛细柱管壁液膜的破裂，以及由于流动相或样品中含有的杂质使固定相被污染或产生缓慢化学反应，柱管材料的锈蚀等都会影响柱寿命，缩短其使用期限。当柱寿命受到影响时，组分的绝对或相对保留值将发生较大变化，柱效将明显下降，必须更换新柱或对色谱柱进行再生处理。