生物分类学是研究生物分类的方法和原理的生物学分支。分类就是遵循分类学原理和方法，对生物的各种类群进行命名和等级划分。对生物进行分类的意义是便于弄清不同类群之间的亲缘关系和进化关系。瑞典生物学家林奈将生物命名后，而后的生物学家才用域(Domain)、界（Kingdom）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）、种（Species）加以分类。种是最基本的分类单位，科是最常用的分类单位。 最上层的界，由怀塔克所提出的五界，比较多人接受，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。从最上层的“界”开始到“种”，愈往下层则被归属的生物之间特征愈相近。 当前最流行的分类是一种五界系统，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。五界系统反映了生物进化的三个阶段和多细胞阶段的三个分支，是有纵有横的分类。它没有包括非细胞形态的病毒在内，也许是因为病毒系统地位不明之故。它的原生生物界内容庞杂，包括全部原生动物和红藻、褐藻、绿藻以外的其他真核藻类，包括了不同的动物和植物。例举：斑马鱼的界门纲目科属种：动物界，脊椎动物门，硬骨鱼纲，鲤形目，鲤科，短担尼鱼属。