是一种中等大小的黑色淡水龟，粗颈龟可通过幼体背甲上的3条脊棱（虽然成体只有1条脊棱）同婆罗洲的其他龟类相区别。背甲的后部还有锯齿状边缘，成体的椎盾区域是扁平的。成年雄性可通过相对更长更粗的尾部来辨别，且腹甲稍显凹陷。除此之外，成年雌性保留有浅色的头部斑点，而雄性的这些斑点会随着生长逐渐褪去。