重庆三峡学院由万县师范专科学校、万县教育学院及重庆三峡经济学校合并成立。这三所学校的前身分别是1956年创建的四川省万县初中师资训练班、1958年创建的万县专区教育行政干部学校、1980年创建的万县地区经委干训班。 1993年1月10日，“三峡大学筹备组”挂牌仪式在万县师专举行。至1993年10月，原万县师范专科学校和万县教育学院完成了实质性的合并。 1994年3月26日，万县师范专科学校、万县教育学院和万县地区工交职工中专学校三校合并，组建为四川三峡学院。 2000年2月15日，经市政府研究并报国家教育部批准，四川三峡学院更名为重庆三峡学院。