闽南文化研究院是在国务院台办、文化部、国务院侨办、台盟中央、全国台联、全国侨联和福建省政府及省直相关部门的关心指导下，在漳州市委、市政府的重视与支持下，整合海峡两岸相关高校优质资源的基础上组建而成的，是集科学研究、学术交流、人才培养、政策咨询、信息服务为一体的综合性教学科研机构。