黑石蜊与同一科的淡菜不同，不是以足丝来固着于岩石或其它物体上，而是利用前背区网纹状的壳纹，在珊瑚礁或岩礁钻孔穴居其中，分布在潮间带至二十公尺深的岩礁中。